Tercatat, PTN ini didirikan pada 3 Maret 1946 dengan nama Perguruan Tinggi Gajah Mada hingga berubah nama pada 19 Desember 1949 menjadi UGM.
3. UIN Sunan Kalijaga Yogyakarta
Perguruan Tinggi Negeri (PTN) ini didirikan pada 26 September 1951. Memiliki usia hampir 70 tahun membuat UIN Sunan Kalijaga menjadi Perguruan Tinggi Agama Islam Negeri tertua di Indonesia.
Berlokasi di Jalan Marsda Adisucipto Nomor 1.
BACA JUGA:Universitas Tertua di Malang Masuk Rangking Dunia, Cek Peringkat Kampusmu
4. Universitas Sanata Dharma (USD)
Posisi ketiga ini ada perguruan tinggi swasta USD, yang mana alamatnya Jalan Affandi, Caturtunggal, Depok, Sleman.
Berdirinya USD pada 17 Desember 1955, yang merupakan ide dari Mohammad Yamin yang kala itu menjabat Menteri pendidikan.
5. Universitas Cokroaminoto Yogyakarta
BACA JUGA:Ini Dia Kampus Tertua dan Masih Berdiri di Kota Palembang, Ulas Sejarah Universitas Sjakhyakirti
Universitas Cokroaminoto Yogyakarta didirikan pada tahun 1955 di bawah Yayasan Pendidikan Islam (YPI) Surakarta.
Setelah itu perguruan tinggi swasta ini beralih dan berkedudukan di Yogyakarta pada 28 Oktober 1979.
Berlokasi kampus di Jalan Perintis Kemerdekaan Jl. Gambiran, Pandeyan, Kec. Umbulharjo, Kota Yogyakarta, DIY.
6. Universitas Sarjanawiyata Tamansiswa (UST)
BACA JUGA:Universitas Tertua di Aceh Masuk Daftar Rangking Dunia, Kampus Mana?
UST Yogyakarta ini berdiri pada tahun 15 November 1955. UST sendiri merupakan perguruan tinggi yang didirikan oleh Bapak Pendidikan Indonesia Ki Hadjar Dewantara.